L'extraordinaire diversité du microbiome des récifs coralliens du Pacifique révélée par la mission Tara

Durant plus de deux ans, la goélette scientifique Tara a collecté dans l'océan Pacifique des milliers d'échantillons qui nous ouvrent aujourd'hui une fenêtre sur la vie microscopique des récifs coralliens. Huit premiers articles parus dans Nature montrent que les espèces de micro-organismes y sont foisonnantes, que certaines bactéries spécialisées y vivent en symbiose avec le récif et que les coraux, qui peuvent perdurer plusieurs siècles, pourraient toutefois être affectés par la multiplication des stress, notamment climatiques.

"Les récifs coralliens sont l’équivalent océanique des forêts primaires par leur foisonnement de vie, explique Denis Allemand, directeur scientifique du Centre Scientifique de Monaco et co-directeur de l’expédition Tara Pacific dédiée à l’étude du microbiome océanique dans l’océan Pacifique. Cette explosion de vie est due à la symbiose avec des micro-algues, mais aussi avec des bactéries, virus et autres organismes. C’est ce que l’on appelle un holobionte : un organisme qui vit avec avec et aux dépens d’autres micro-organismes qu’il héberge."

68.000 échantillons collectés dans 99 récifs coralliens différents

"Entre 2016 et 2018, la mission Tara Pacific a parcouru 100.000 km pour collecter quelque 68.000 échantillons dans 99 récifs différents issus de 32 systèmes insulaires du Pacifique, un océan qui abrite 60% des récifs coralliens mondiaux, expose Denis Allemand. On a ainsi prélevé l’eau du lagon, autour des colonies, autour du récif, du tissu de corail pour des études moléculaires, des échantillons de squelette pour reconstituer son passé, des échantillons d’air au-dessus du récif, des photos, etc. Il a ainsi été possible de mesurer l’ampleur de la diversité des états physiologiques, entre les récifs situés auprès des activités humaines et ceux qui en sont éloignés, avec des récifs sains et d’autres subissant des stress à répétition."

Prélèvements lors de la mission Tara Pacific Crédit : Pete West - Fondation Tara Ocean
Prélèvements lors de la mission Tara Pacific Crédit : Pete West - Fondation Tara Ocean

Prélèvements lors de la mission Tara Pacific. Crédits : Pete West - Fondation Tara Océan

L’analyse de ces échantillons a donné lieu à huit premières publications scientifiques publiées jeudi 1er juin 2023 dans Nature Communications. L’une d’entre elles montre que la diversité des micro-organismes de ces récifs coralliens (leur microbiome) pourrait atteindre une valeur proche de la diversité totale estimée jusque-là des micro-organismes sur Terre. "Il y a une diversité fascinante dans ces récifs, s’enthousiasme Pierre Galand, chercheur à l’Observatoire Océanologique de Banyuls et auteur de deux des études publiées. On peut en déduir[...]

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