Yahoo Actualités Covid-19 : toute personne infectée porte en elle plusieurs variants en même temps
Le séquençage du coronavirus chez un patient retient uniquement le variant majoritaire, alors que plusieurs autres variants minoritaires sont aussi présents, dont certains pourraient devenir majoritaires après.
Attention, un variant peut en cacher un autre ! Le séquençage du virus à travers le monde a permis de mettre en évidence l’évolution du coronavirus et l’émergence des nouveaux variants qui se sont succédé depuis le début de la pandémie. Cependant, ces séquençages ne présentent en général que la séquence la plus nombreuse chez un individu infecté. Alors qu’en réalité, ces séquences majoritaires sont toujours accompagnées de plusieurs autres avec des modifications génétiques différentes de celles présentes dans la séquence majoritaire. Cette révélation a été faite par des chercheurs de l’Université Case Western Reserve, dans l’Ohio (États-Unis), dans un article publié le 8 septembre 2022 dans la revue . Et cette découverte pourrait nous donner une longueur d’avance sur le virus et son évolution.
Une grande diversité génétique
Les chercheurs ont étudié en profondeur les séquences de SARS-CoV-2 présentes chez 254 patients mettant en évidence une grande diversité génétique du virus dans chacun des patients (254 patients recrutés pour cette étude, plus 110 provenant de bases de données internationales). Un total de 1.096 positions de la séquence d’ARN du virus présentaient au moins une modification différente de celle dans la séquence majoritaire, dont 406 étaient observées dans plusieurs patients (75 d’entre elles chez plus de 10 patients).
Des mutations invisibles
Parmi ces 75 mutations alternatives les plus fréquentes, 30 n’étaient majoritaires chez aucun de patient. C’est-à-dire qu’elles n’auraient été reportées dans le séquençage officiel, qui prend en compte uniquement le nucléotide le plus fréquent dans chaque position pour chaque patient. Ces mutations auraient donc été complètement ignorées, alors qu’elles représentent un nombre non négligeable d’évènements (2.865 apparitions chez ces patients). Pire, même celles qui étaient majoritaires chez au moins une personne auraient été ignorées dans la majorité de cas (1.553 cas contre 1.143 cas où elles auraient été pri[...]
