Nos gènes influencent la composition de notre microbiote

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Notre tube digestif habite des milliards de micro-organismes : bactéries, virus, et champignons. Ceux-ci tapissent les parois des intestins, particulièrement celles du gros intestin (côlon). C’est ce que l’on appelle le microbiote intestinal ou flore intestinale. Ces micro-organismes vivent en symbiose avec notre corps, qui est leur hôte. Un déséquilibre du microbiote peut déclencher de nombreuses pathologies, notamment des maladies auto-immunes et inflammatoires.

Notre microbiote se constitue progressivement depuis la naissance jusqu’à l’âge adulte en fonction de l’alimentation, du niveau d’hygiène, des médicaments reçus, de l’environnement mais aussi en fonction de la génétique de l’individu. C’est le lien entre génétique humaine et microbiote intestinal qu’une équipe a souhaité approfondir. Leurs travaux ont été publiés le 9 mars 2022 dans la revue Scientific Reports du groupe Nature.

Analyser plusieurs mutations en même temps

Lorsqu’une maladie est la conséquence d’une seule mutation génétique, il est relativement aisé de l’identifier. S’il s’agit de la substitution d’un seul nucléotide, on parle de polymorphisme d’un seul nucléotide (SNP ou Single Nucleotide Polymorphism, en anglais). La plupart des études existantes sur la relation entre génétique humaine et composition du microbiote se sont penchées sur l’influence d’un seul SNP à la fois. Les auteurs de cette étude ont souhaité identifier le rôle de plusieurs SNP à la fois grâce à un procédé statistique particulier : l’analyse de corrélation canonique étendue. Il s’agit d’une méthode statistique descriptive multidimensionnelle. Ainsi, les liens entre SNP et survenue de certaines maladies (diabète de type 2, troubles neurologiques, cancers) ont été testés chez 250 individus, 35 paires de jumeaux monozygotes (n=70) et 90 paires de jumeaux dizygotes (n=180).

Nos intestins sont tapissés de bactéries, de virus et de champignons. © Alex, Adobe Stock
Nos intestins sont tapissés de bactéries, de virus et de champignons. © Alex, Adobe Stock

De nouvelles associations entre génétique et microbiote

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