Covid-19 : les variants du variant Delta, une course pour la conquête de la planète

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Le variant Delta s’est emparé du globe : il représente désormais la presque totalité des nouveaux cas en France et dans le monde. Mais cette situation cache une course entre plusieurs descendants du Delta originel.

Un variant peut en cacher un autre ! Comme toutes les deux semaines, Santé publique France a publié sa nouvelle analyse de risque sur les variants émergents du SARS-CoV-2 (). Montrant une situation très différente de celle observée à la , quand Alpha était encore largement majoritaire et Delta débutait à peine sa conquête de la France.

Delta domine la France et le monde

Aujourd’hui, la situation est complètement inversée : Delta représente 98 % des nouveaux cas répertoriés dans l’Hexagone, alors que les autres variants qui inquiétaient la France en mai, notamment Beta, Gamma et 20I/484K (variant du variant Alpha), ont presque disparu du territoire (voir graphique 1).

Graphique 1. Évolution des variants majoritaires en France entre les mois de juin et juillet 2021, selon les enquêtes Flash de Santé publique France. Seuls les variants détectés dans la dernière enquête sont présentés. Crédit : Nicolas Gutierrez C.

Cette domination de Delta ne s’arrête pas aux frontières françaises. Selon le site de partage de séquences internationales de Sars-CoV-2 , le variant Delta représentait 97,62 % des séquences mondiales partagées pendant la semaine 32 (du 3 au 9 août). Cependant, cet apparent monopole épidémique cache une réalité bien plus complexe. Car grâce à sa propagation globale, le variant Delta a pu lui-même évoluer, donnant naissance à des petits variants qui concourent entre eux pour la domination mondiale.

Les sous-variants de Delta

Selon le site , conçu par des chercheurs de l’École polytechnique fédérale de Zurich avec les données de Gisaid, au moins 12 variants issus du Delta originel sont actuellement dans cette compétition (voir graphique 2).

Graphique 2. Évolution des sous-variants du variant Delta dans le monde depuis la mi-mai (semaine 20), représentés comme le pourcentage de séquences partagées par semaine. La version originelle de Delta (bleu foncé) représente environ la moitié du total. Crédit : Nicolas Gutierrez C.

Selon les estimations de l’avantag[...]

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