Covid-19 : faut-il s'inquiéter de la montée du variant Delta en Nouvelle-Aquitaine ?

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Une poussée du variant Delta (initialement détecté en Inde) fait craindre une reprise épidémique dans cette région jusqu’alors peu touchée par la pandémie.

Le sud-ouest sous la menace Delta… Alors que la situation épidémiologique s’améliore dans la majorité du pays et que la fin des restrictions est attendue avec impatience, un début d’orage menace de gâter l’été en Nouvelle-Aquitaine. Car malgré l’arrivée des beaux jours, le nombre de cas ne cesse d’augmenter depuis deux semaines dans cette région relativement épargnée lors des trois vagues précédentes. Notamment dans une poignée de départements où des variants inquiétants ont été détectés, dont le redoutable variant Delta (anciennement connu comme variant indien). Souche qui assombrit déjà l’été britannique, pays , pays où il est déjà majoritaire. La montée des cas observée dans cette région est-elle due à ce variant ? Analyse.

Six départements sont à la hausse

À l’opposé du reste de l’Hexagone, le taux d’incidence monte depuis deux semaines dans plusieurs départements du sud-ouest, notamment aux Pyrénées-Atlantiques, en Gironde et dans les Landes (voir le graphique 1 ci-dessous). Pour le moment, il est difficile de savoir exactement combien de ces cas sont dus au variant Delta, car celui-ci n’est pas reconnu par les PCR de criblage actuellement utilisées. "Les échantillons des nouveaux cas sont analysés par une PCR qui identifie les variants Alpha et Bêta ou Gamma. Les autres variants étant classés comme absence de variant, explique Laurent Filleul, responsable régional à Santé publique France pour la Nouvelle Aquitaine. Ceux-là, on les fait séquencer par le Centre de référence des virus des infections respiratoires ou par le CHU de la région et on étudie les chaines de contaminations pour chaque cas."

Graphique 1. Départements en Nouvelle Aquitaine où le taux incidence (nombre de cas pour 100.000 habitants sur 7 jours) est à la hausse. Crédit : Nicolas Gutierrez C.

Cette hausse est associée à une augmentation des cas Delta

Dans les trois départements où l’incidence monte le plus (Gironde, Landes et Pyrénées-Atlantiques), cette augmentation du nombre de cas semble corrélée à une montée de la proportion des cas classés "absence de variant" (c[...]

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